Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apoa1Q00623 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms