Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrkacbP68181 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrkacbP68181 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms