Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aqp4P55088 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aqp4P55088 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms