Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PctpP53808 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PctpP53808 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PctpP53808 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PctpP53808 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PctpP53808 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PctpP53808 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms