Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CntfP51642 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CntfP51642 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CntfP51642 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CntfP51642 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CntfP51642 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CntfP51642 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms