Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt2P50752 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt2P50752 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms