Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP4P49662 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP4P49662 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP4P49662 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP4P49662 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP4P49662 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms