Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb42P49222 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms