Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes1P35428 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hes1P35428 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms