Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoc1P34928 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms