Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxa2P31245 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxa2P31245 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms