Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-DMaP28078 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-DMaP28078 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms