Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clk1P22518 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk1P22518 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clk1P22518 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms