Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ntf3P20181 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ntf3P20181 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms