Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Csf3P09920 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csf3P09920 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms