Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxa1P09022 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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