Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TtrP07309 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TtrP07309 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TtrP07309 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TtrP07309 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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TtrP07309 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TtrP07309 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TtrP07309 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TtrP07309 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TtrP07309 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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