Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Copb2O55029 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copb2O55029 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms