Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kpna6O35345 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kpna6O35345 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms