Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm21887J3QQ04 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms