Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc179J3QM76 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms