Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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