Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hmgxb3G3X9M3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms