Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc171E9Q1U1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc171E9Q1U1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
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