Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cspp1B2RX88 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms