Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3173A6NAS3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms