Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Calcoco2A2A6M5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Calcoco2A2A6M5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms