Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc22a4Q9Z306 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc22a4Q9Z306 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc22a4Q9Z306 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc22a4Q9Z306 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc22a4Q9Z306 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc22a4Q9Z306 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a4Q9Z306 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a4Q9Z306 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc22a4Q9Z306 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc22a4Q9Z306 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc22a4Q9Z306 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms