Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc45Q9Z1X9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cdc45Q9Z1X9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc45Q9Z1X9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc45Q9Z1X9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdc45Q9Z1X9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc45Q9Z1X9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdc45Q9Z1X9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc45Q9Z1X9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdc45Q9Z1X9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc45Q9Z1X9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdc45Q9Z1X9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc45Q9Z1X9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdc45Q9Z1X9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdc45Q9Z1X9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc45Q9Z1X9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdc45Q9Z1X9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc45Q9Z1X9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdc45Q9Z1X9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdc45Q9Z1X9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc45Q9Z1X9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc45Q9Z1X9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc45Q9Z1X9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc45Q9Z1X9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc45Q9Z1X9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc45Q9Z1X9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc45Q9Z1X9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc45Q9Z1X9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc45Q9Z1X9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdc45Q9Z1X9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc45Q9Z1X9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc45Q9Z1X9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc45Q9Z1X9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdc45Q9Z1X9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdc45Q9Z1X9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms