Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn3Q9Z0Y1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dctn3Q9Z0Y1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Dctn3Q9Z0Y1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms