Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srd5a3Q9WUP4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srd5a3Q9WUP4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srd5a3Q9WUP4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srd5a3Q9WUP4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srd5a3Q9WUP4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srd5a3Q9WUP4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Srd5a3Q9WUP4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srd5a3Q9WUP4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srd5a3Q9WUP4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srd5a3Q9WUP4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srd5a3Q9WUP4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms