Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Itgb1bp2Q9R000 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb1bp2Q9R000 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb1bp2Q9R000 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb1bp2Q9R000 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb1bp2Q9R000 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb1bp2Q9R000 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb1bp2Q9R000 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms