Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ripk3Q9QZL0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ripk3Q9QZL0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ripk3Q9QZL0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ripk3Q9QZL0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ripk3Q9QZL0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ripk3Q9QZL0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ripk3Q9QZL0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ripk3Q9QZL0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ripk3Q9QZL0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ripk3Q9QZL0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ripk3Q9QZL0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ripk3Q9QZL0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms