Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec4aQ9QZ15 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec4aQ9QZ15 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec4aQ9QZ15 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec4aQ9QZ15 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4aQ9QZ15 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clec4aQ9QZ15 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clec4aQ9QZ15 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4aQ9QZ15 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4aQ9QZ15 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4aQ9QZ15 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec4aQ9QZ15 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec4aQ9QZ15 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4aQ9QZ15 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4aQ9QZ15 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4aQ9QZ15 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4aQ9QZ15 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clec4aQ9QZ15 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms