Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdkl2Q9QUK0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl2Q9QUK0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl2Q9QUK0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl2Q9QUK0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkl2Q9QUK0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl2Q9QUK0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl2Q9QUK0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.7 ms