Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp3a41aQ9JMA7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp3a41aQ9JMA7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp3a41aQ9JMA7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp3a41aQ9JMA7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp3a41aQ9JMA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp3a41aQ9JMA7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp3a41aQ9JMA7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp3a41aQ9JMA7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms