Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pias4Q9JM05 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pias4Q9JM05 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pias4Q9JM05 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pias4Q9JM05 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pias4Q9JM05 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pias4Q9JM05 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pias4Q9JM05 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pias4Q9JM05 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pias4Q9JM05 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pias4Q9JM05 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pias4Q9JM05 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pias4Q9JM05 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pias4Q9JM05 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pias4Q9JM05 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pias4Q9JM05 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pias4Q9JM05 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms