Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Higd1aQ9JLR9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Higd1aQ9JLR9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Higd1aQ9JLR9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Higd1aQ9JLR9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Higd1aQ9JLR9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms