Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cd2apQ9JLQ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cd2apQ9JLQ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cd2apQ9JLQ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cd2apQ9JLQ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cd2apQ9JLQ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cd2apQ9JLQ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cd2apQ9JLQ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cd2apQ9JLQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cd2apQ9JLQ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cd2apQ9JLQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cd2apQ9JLQ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cd2apQ9JLQ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cd2apQ9JLQ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cd2apQ9JLQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cd2apQ9JLQ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cd2apQ9JLQ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cd2apQ9JLQ0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cd2apQ9JLQ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cd2apQ9JLQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cd2apQ9JLQ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cd2apQ9JLQ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd2apQ9JLQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cd2apQ9JLQ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cd2apQ9JLQ0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cd2apQ9JLQ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cd2apQ9JLQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cd2apQ9JLQ0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cd2apQ9JLQ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cd2apQ9JLQ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cd2apQ9JLQ0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms