Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3glb1Q9JK48 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3glb1Q9JK48 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3glb1Q9JK48 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3glb1Q9JK48 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh3glb1Q9JK48 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3glb1Q9JK48 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3glb1Q9JK48 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3glb1Q9JK48 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3glb1Q9JK48 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms