Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smad9Q9JIW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad9Q9JIW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad9Q9JIW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad9Q9JIW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smad9Q9JIW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad9Q9JIW5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms