Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lgi1Q9JIA1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lgi1Q9JIA1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lgi1Q9JIA1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lgi1Q9JIA1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lgi1Q9JIA1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgi1Q9JIA1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lgi1Q9JIA1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgi1Q9JIA1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms