Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf13bQ9ET35 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf13bQ9ET35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf13bQ9ET35 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf13bQ9ET35 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf13bQ9ET35 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf13bQ9ET35 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf13bQ9ET35 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfrsf13bQ9ET35 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf13bQ9ET35 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnfrsf13bQ9ET35 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnfrsf13bQ9ET35 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms