Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sall1Q9ER74 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sall1Q9ER74 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall1Q9ER74 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sall1Q9ER74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sall1Q9ER74 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sall1Q9ER74 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sall1Q9ER74 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sall1Q9ER74 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Sall1Q9ER74 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sall1Q9ER74 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sall1Q9ER74 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall1Q9ER74 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms