Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col4a3bpQ9EQG9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a3bpQ9EQG9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col4a3bpQ9EQG9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col4a3bpQ9EQG9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col4a3bpQ9EQG9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Col4a3bpQ9EQG9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col4a3bpQ9EQG9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col4a3bpQ9EQG9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col4a3bpQ9EQG9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col4a3bpQ9EQG9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms