Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn1r44Q9EQ47 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r44Q9EQ47 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r44Q9EQ47 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r44Q9EQ47 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r44Q9EQ47 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms