Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tlr1Q9EPQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tlr1Q9EPQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr1Q9EPQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr1Q9EPQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tlr1Q9EPQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr1Q9EPQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tlr1Q9EPQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tlr1Q9EPQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tlr1Q9EPQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tlr1Q9EPQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr1Q9EPQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr1Q9EPQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr1Q9EPQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr1Q9EPQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms