Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP96

Slco1a4, Solute carrier organic anion transporter family member 1A4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a4Q9EP96 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slco1a4Q9EP96 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slco1a4Q9EP96 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slco1a4Q9EP96 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slco1a4Q9EP96 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slco1a4Q9EP96 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slco1a4Q9EP96 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slco1a4Q9EP96 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slco1a4Q9EP96 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slco1a4Q9EP96 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slco1a4Q9EP96 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slco1a4Q9EP96 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slco1a4Q9EP96 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms