Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan4Q9DCK3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan4Q9DCK3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tspan4Q9DCK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tspan4Q9DCK3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan4Q9DCK3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tspan4Q9DCK3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tspan4Q9DCK3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms