Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Riok3Q9DBU3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Riok3Q9DBU3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Riok3Q9DBU3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Riok3Q9DBU3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Riok3Q9DBU3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Riok3Q9DBU3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Riok3Q9DBU3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riok3Q9DBU3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Riok3Q9DBU3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riok3Q9DBU3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Riok3Q9DBU3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riok3Q9DBU3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riok3Q9DBU3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Riok3Q9DBU3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Riok3Q9DBU3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms